A Skype-ot használók jelentős része feltehetően platformtól függetlenül annak hivatalos kliensét preferálja, ám kompatibilis a szolgáltatással jó néhány külsős fejlesztőtől származó szoftver (például az IM+) is, ezeket főként az egyszerre több csevegőbe bejelentkezni kívánók részesítik előnyben.
Sajnos az év végével ezen szoftverekből ki fog kerülni az Skype-ba való bejelentkezési lehetőség, ugyanis a Microsoft bejelentette a szolgáltatás külső kommunikációs felületeinek (Desktop API) lekapcsolását; ennek megtörténte után csak a hivatalos klienssel lehet majd használni a szolgáltatást. A lépés megtételét azzal indokolja a vállalat, hogy mobilos platformokon nem használható az eredetileg még 2004-ben elérhetővé tett programozási felület.
Januártól kezdve a fejlesztők kizárólag a Skype URI-t használhatják majd, azaz olyan linkeket és gombokat helyezhetnek a weboldalaikba vagy programjaikba, amelyekre kattintva például hívást vagy csevegést kezdeményez az eszközre feltelepített hivatalos kliensprogram.
