A Windows 10 egyik meglepő tulajdonsága, hogy lehetővé teszi a linuxos alkalmazások natív futtatását. Ez a Linuxhoz írt Windows-alrendszernek köszönhető, ami bétaként érhető el a Windows 10 megjelenése óta.
A Microsoft azonban a béta végéhez közeledik, a Windows 10 őszi alkotói frissítésében ugyanis a funkció már hivatalosan is támogatott lesz.
A Microsoft az évek során számos fejlesztést hajtott végre ezen a Windows-alrendszeren, többé a fejlesztői módot sem kell engedélyezni. Az Ubuntu mellett ráadásul a Fedora, az OpenSUSE vagy a SUSE Enterprise Linux is bevethető, a windowsos appok a Bash terminálon, a linuxos appok a Windows PowerShellen keresztül futtathatóak.
Hivatalosan csak a parancssoros alkalmazások támogatottak, vagyis azok a fejlesztők vannak a célkeresztben, akik Windows-környezetben végeznék a munkát, de Linux-eszközzel. Nem hivatalos módon persze a grafikus felület betöltése is megoldható.